邬荣领教授团队在基因表达与环境互作的调控网络研究取得突破

通讯员李鑫

由我校ManBetX China·中国ManBetX™计算生物学中心、信息学院、以及美国三所大学研究人员发展的基因表达可塑性调控网络的建模与计算研究取得原创性突破。

该模型以信息熵理论为基础，对基因表达与环境互作的内在机理进行聚类分析和依赖关系量化分析，能够发现基因表达受环境影响的概貌、因果关系和量化细节。

这一成果近期在线发表在国际著名学术刊物 Nucleic Acids Research （最新影响因子8.026）上，首次以基因可塑性为变量进行互信息的计算和分析，发现了基因表达在基因组内、基因组间、以及不同环境下的复杂的非线性调控依赖关系。

在我校计算生物学中心主任邬荣领教授创立的ManBetX中国官网-宾夕法尼亚州立大学合作研究平台上，信息学院的王建新博士在中美两地经过一年半时间的潜心研究，终于攻克了信息熵理论与基因表达可塑性的融合建模这一世界性难题。这一工作的责任作者、计算生物学专家邬荣领教授对王建新博士刻苦钻研、敢于挑战的精神极为赞赏, 认为这一工作为理解和研究生物与环境互作、进而为研究不同物种之间的互作和协同进化提供了新的有力工具。

参加该项工作的还有信息学院的硕士研究生陈波、美国宾夕法尼亚州立大学的博士研究生王亚群和王宁涛，美国休斯敦大学计算机系的Marc Garbey教授、美国佛罗里达大学医学工程系的Roger Tran-Son-Tay教授和医疗系的Scott A. Berceli教授。这一研究是我校院际合作的典范, 更是我校计算生物学中心主导的多领域、跨学科国际合作的成果之一, 有力提高了我校在计算生物学领域的国际影响力。

论文链接：
http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/03/06/nar.gkt147.full.pdf+html